第一卷：在小城市里的某处秘密隐藏着一棵无人操作的光秃树形漆黑装置，所有被树操纵的“怪人”杀死的人一部分会变成新的怪人，另一部分会变成改造人。树形系统操纵怪人与不知情的改造人战斗，为达成某个不可告人的研究。
第二卷：第一卷的前传。失忆的男主自身的过去，揭秘自身的身世。
第三卷：树形装置背后的组织消亡后被其他组织吸收，开始继续另一项研究，并找到了男主要求配合。